Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMA3P25788 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms