Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL3L1P16619 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL3L1P16619 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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