Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRCP08575 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRCP08575 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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