Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms