Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD6O43541 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms