Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAF3IP3Q9Y228 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3IP3Q9Y228 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAF3IP3Q9Y228 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP3Q9Y228 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms