Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMURF2Q9HAU4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMURF2Q9HAU4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms