Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf13Q9D777 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfsf13Q9D777 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms