Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCSER1Q9C0I3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
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