Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMO3Q8TAP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMO3Q8TAP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO3Q8TAP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms