Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata4Q8K3V1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata4Q8K3V1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spata4Q8K3V1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata4Q8K3V1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata4Q8K3V1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata4Q8K3V1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata4Q8K3V1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata4Q8K3V1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spata4Q8K3V1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms