Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk3Q8BWQ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dclk3Q8BWQ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms