Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd42Q3V096 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd42Q3V096 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd42Q3V096 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ankrd42Q3V096 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd42Q3V096 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd42Q3V096 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms