Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctps1P70698 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctps1P70698 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctps1P70698 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms