Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cav1P49817 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cav1P49817 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cav1P49817 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cav1P49817 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cav1P49817 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cav1P49817 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cav1P49817 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cav1P49817 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cav1P49817 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms