Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A2P23975 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A2P23975 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms