Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD33P20138 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD33P20138 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD33P20138 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD33P20138 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD33P20138 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD33P20138 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD33P20138 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD33P20138 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD33P20138 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD33P20138 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD33P20138 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD33P20138 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD33P20138 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD33P20138 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD33P20138 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD33P20138 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD33P20138 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD33P20138 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD33P20138 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD33P20138 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD33P20138 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD33P20138 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD33P20138 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD33P20138 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD33P20138 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD33P20138 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD33P20138 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD33P20138 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD33P20138 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms