Protein–RNA interactions for Protein: P08882

Gzmc, Granzyme C, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmcP08882 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GzmcP08882 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmcP08882 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GzmcP08882 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmcP08882 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmcP08882 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GzmcP08882 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms