Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX1O43933 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX1O43933 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX1O43933 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX1O43933 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX1O43933 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX1O43933 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX1O43933 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX1O43933 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX1O43933 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX1O43933 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX1O43933 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX1O43933 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX1O43933 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX1O43933 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX1O43933 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX1O43933 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX1O43933 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX1O43933 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX1O43933 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX1O43933 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX1O43933 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX1O43933 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX1O43933 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX1O43933 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX1O43933 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX1O43933 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX1O43933 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX1O43933 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX1O43933 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX1O43933 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX1O43933 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX1O43933 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX1O43933 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX1O43933 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX1O43933 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX1O43933 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX1O43933 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX1O43933 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX1O43933 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX1O43933 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms