Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 YML6YML025C 861 nt7.28□□□□□ -1.24
YRF1-4O13559 GIR2YDR152W 798 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YRA1YDR381W 681 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YGR182CYGR182C 354 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YAP1801YHR161C 1914 nt7.27□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YGR176WYGR176W 348 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 DAL82YNL314W 768 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YBR124WYBR124W 360 nt7.26□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 GLE1YDL207W 1617 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YER186CYER186C 921 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 NPA3YJR072C 1158 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YMR010WYMR010W 1218 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 PRP24YMR268C 1335 nt7.25□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 DIA3YDL024C 1407 nt7.24□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 RAD3YER171W 2337 nt7.24□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YML082WYML082W 1950 nt7.24□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YLR118CYLR118C 684 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 NOB1YOR056C 1380 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 ERG12YMR208W 1332 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 VPS4YPR173C 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 NUD1YOR373W 2556 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 TIM54YJL054W 1437 nt7.23□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YEA6YEL006W 1008 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 XBP1YIL101C 1944 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 PRP46YPL151C 1356 nt7.22□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 YNR040WYNR040W 771 nt7.21□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 NOG2YNR053C 1461 nt7.21□□□□□ -1.25
YRF1-4O13559 HSP78YDR258C 2436 nt7.21□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 ASN2YGR124W 1719 nt7.21□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 ERC1YHR032W 1746 nt7.21□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 HIS7YBR248C 1659 nt7.21□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YDR514CYDR514C 1452 nt7.21□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 RTT106YNL206C 1368 nt7.21□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YER148W-AYER148W-A 579 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 HAP2YGL237C 798 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 LYS12YIL094C 1116 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 SOG2YOR353C 2376 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 SGE1YPR198W 1632 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YOL036WYOL036W 2286 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YER010CYER010C 705 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YJR115WYJR115W 510 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YKL151CYKL151C 1014 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 IDP3YNL009W 1263 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YOS9YDR057W 1629 nt7.2□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 TAL1YLR354C 1008 nt7.19□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 ATG22YCL038C 1587 nt7.18□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 SGV1YPR161C 1974 nt7.18□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 BIM1YER016W 1035 nt7.18□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 RME1YGR044C 903 nt7.18□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YHC3YJL059W 1227 nt7.18□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 CEF1YMR213W 1773 nt7.17□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 PRO3YER023W 861 nt7.17□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 RPS2YGL123W 765 nt7.17□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 HSX1tR(CCU)J 72 nt7.17□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 HMS2YJR147W 1077 nt7.17□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YPK2YMR104C 2034 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YME1YPR024W 2244 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 VMA2YBR127C 1554 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YDL034WYDL034W 345 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 RPT6YGL048C 1218 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 RPN7YPR108W 1290 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 STB5YHR178W 2232 nt7.16□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 NDC1YML031W 1968 nt7.15□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 VNX1YNL321W 2727 nt7.15□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 SLO1YER180C-A 258 nt7.15□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 AVT4YNL101W 2142 nt7.15□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 YOR300WYOR300W 309 nt7.15□□□□□ -1.26
YRF1-4O13559 PAT1YCR077C 2391 nt7.14□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 STM1YLR150W 822 nt7.14□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 ATP14YLR295C 375 nt7.14□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 MHR1YDR296W 681 nt7.13□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 CAD1YDR423C 1230 nt7.13□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 TFS1YLR178C 660 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 YOR318CYOR318C 306 nt7.12□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt7.11□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 SAM4YPL273W 978 nt7.11□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 FAF1YIL019W 1041 nt7.1□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 RIO1YOR119C 1455 nt7.09□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 BBP1YPL255W 1158 nt7.09□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 YEH1YLL012W 1722 nt7.09□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 DAL7YIR031C 1665 nt7.09□□□□□ -1.27
YRF1-4O13559 COG1YGL223C 1254 nt7.08□□□□□ -1.28
YRF1-4O13559 KSS1YGR040W 1107 nt7.08□□□□□ -1.28
YRF1-4O13559 OAC1YKL120W 975 nt7.08□□□□□ -1.28
YRF1-4O13559 YNL296WYNL296W 315 nt7.08□□□□□ -1.28
YRF1-4O13559 HSF1YGL073W 2502 nt7.08□□□□□ -1.28
YRF1-4O13559 VPS5YOR069W 2028 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.9 ms