Protein–RNA interactions for Protein: F6TUL9

Vsig4, V-set and immunoglobulin domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig4F6TUL9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig4F6TUL9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig4F6TUL9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms