Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
A0A0J9YXV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A0A0J9YXV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms