Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIMKLBQ9ULI2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms