Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNOT11Q9UKZ1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms