Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD5Q9P267 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms