Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TDP1Q9NUW8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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TDP1Q9NUW8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TDP1Q9NUW8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TDP1Q9NUW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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TDP1Q9NUW8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TDP1Q9NUW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TDP1Q9NUW8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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