Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms