Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RNFT2Q96EX2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RNFT2Q96EX2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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RNFT2Q96EX2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RNFT2Q96EX2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RNFT2Q96EX2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RNFT2Q96EX2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RNFT2Q96EX2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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