Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP31Q70CQ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP31Q70CQ4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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