Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG16L1Q676U5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms