Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms