Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA3AQ14563 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms