Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GBX1Q14549 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GBX1Q14549 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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