Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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