Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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