Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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