Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAD4Q13485 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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