Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FOXE3Q13461 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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