Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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SP140Q13342 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SP140Q13342 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SP140Q13342 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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