Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NR1H3Q13133 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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