Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UBE3AQ05086 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms