Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POU5F1Q01860 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms