Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms