Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EEFSECP57772 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEFSECP57772 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms