Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms