Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GCAP28676 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GCAP28676 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCAP28676 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GCAP28676 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCAP28676 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCAP28676 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms