Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms