Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA1P25391 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA1P25391 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms