Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRDP23468 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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