Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYT1P21579 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT1P21579 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT1P21579 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT1P21579 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT1P21579 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYT1P21579 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYT1P21579 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYT1P21579 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms